5 октября 2012 года в Москве в Кремлевском Дворце прошел Первый съезд врачей Российской Федерации. Всего в работе Съезда приняли участие более 5 тысяч 700 делегатов: врачи из всех регионов России, представляющие все медицинские специальности и медицинские организации разного уровня государственной и частной систем здравоохранения, руководители регионального здравоохранения, заместители руководителей регионов по социальной политике, ведущие учёные и преподаватели медицинских вузов, представители профсоюза медицинских работников. Ярославскую медицинскую академию в составе ярославской делегации представляли А.В.Павлов, Ю.В.Новиков, А.А.Баранов, П.С.Жбанников, С.В.Кашин.
25 сентября в аудитории № 1 Главного корпуса состоялась конференция студенческого Совета академии. С отчётом за год деятельности Совета выступила его председатель, студентка 6 курса лечебного факультета Дарья Матвеева.
В соответствие с письмами Министерства здравоохранения Российской Федерации № 16-3/10/2-790 от 20.07.2012 г. и № 16-2/10/2-1911 от 31.08.2012 г. 21-22 сентября 2012 г. в городе Ярославле на базе ГБОУ ВПО «Ярославская государственная медицинская академия» Минздрава России проведено заседание Координационных советов по послевузовскому и дополнительному профессиональному образованию специалистов здравоохранения Центрального и Приволжского федеральных округов.
12 сентября в академии прошла ежегодная конференция научно-педагогических работников, представителей других категорий работников и обучающихся. 
1 сентября на лечебном, педиатрическом, стоматологическом и фармацевтическом факультетах прошел День знаний.
